খাগড়াছড়ি শহরের ভেতর দিয়ে প্রবাহিত খাগড়াছড়ি খাল এবং রাঙাপানিছড়াসহ ছোটবড়ো প্রাকৃতিক নালাগুলোর দুইপাশ অবৈধ দখলের ফলে ক্রমশ: সরু হয়ে আসছে। আসন্ন বর্ষার সময় উপরের বিস্তীর্ণ এলাকা থেকে নেমে আসা পানি শহরের মাঝ দিয়ে সহজে নেমে যাওয়ার একমাত্র মাধ্যম এই কয়টি খাল আর ছড়ার ধারণ ক্ষমতা কমে গেলে শহরের ভেতর প্রবল জলাবদ্ধতা দেখা দিতে পারে। যা অতীতে দৃশ্যমান হয়েছিলো।

সাম্প্রতিক সময়ে দেখা যাচ্ছে, শহরের মিলনপুর (চৌধুরী বোর্ডিং ও সেলিম ট্রেড সেন্টার), বাজার ব্রিজের দক্ষিণে এবং উত্তরে হোটেল জিরান এলাকা, বাজার মসজিদের পেছনের এলাকা, খাগড়াপুর (কমিউনিটি সেন্টারের পেছনে), মাস্টারপাড়ায় খাগড়াছড়ি খালের পূর্বাংশ, ইসলামপুর (ব্রিজের পশ্চিম পাশের্^) এবং কলাবাগানের উত্তরাংশে (ক্যান্টনমেন্ট সংলগ্ন) এলাকায় ব্যক্তি উদ্যোগে পাকা স্থাপনা নির্মাণ করা হচ্ছে। পৌর কর্তৃপক্ষ অঅনুমোদিত এসব অবকাঠামোর ফলে পানি স্বাভাবিক প্রবাহ মারাত্মক ব্যাহত হবে। পাশাপাশি অপেক্ষাকৃত দরিদ্র মানুষের ভূমি-বসতবাড়িসহ অন্যান্য স্থাপনা হুমকির মুখে পড়ছে। সূত্র-পাহাড়বার্তাডটকম